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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_93370
Cell Name :  20170213-13-004
Archive Name :  Lee_LJ
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL6 x B6.129P2(C)-Mecp2+/y
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.2 months
Max Age :  1.2 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, barrel, layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  stellate
Tertiary Cell Class :  Spiny
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Mecp2 KO
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  flattened
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  15x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-03-31
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  20170213-13-004.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Structural and functional differences in the barrel cortex of Mecp2 null mice.

Measurements
Soma Surface :  332.35 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  19
Number of Branches :  43
Overall Width :  79.48 μm
Overall Height :  130.09 μm
Overall Depth :  15.24 μm
Average Diameter :  0.18 μm
Total Length :  753.67 μm
Total Surface :  423.87 μm2
Total Volume :  19.02 μm3
Max Euclidean Distance :  105.97 μm
Max Path Distance :  116.83 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  238
Partition Asymmetry :  0.47
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  58.91°
Average Bifurcation Angle Remote :  60.27°
Fractal Dimension :  1.03

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