8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_282761
Cell Name :  20170118_BGUG_HuC_ltRFP_d6_F3_N2
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-s1013tET
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 days
Max Age :  7.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  periventricular layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Periventricular Projection Neurons (PVPN)
Tertiary Cell Class :  Dorsal thalamus-projecting, Pretectum-projecting, Class 1
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2020-11-24
Date of Upload :  2024-04-30
Persistence Vector :  20170118_BGUG_HuC_ltRFP_d6_F3_N2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Topography of a Visuomotor Transformation.

Measurements
Soma Surface :  1854.47 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  25
Number of Branches :  51
Overall Width :  49.79 μm
Overall Height :  284.02 μm
Overall Depth :  211.53 μm
Average Diameter :  4.68 μm
Total Length :  1138.51 μm
Total Surface :  18299.6 μm2
Total Volume :  25744.6 μm3
Max Euclidean Distance :  298.74 μm
Max Path Distance :  694.81 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  536
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  2.31
Average Bifurcation Angle Local :  77.94°
Average Bifurcation Angle Remote :  72.98°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website