8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_282721
Cell Name :  20170111_BGUG_HuC_ltRFP_d5_F1
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-s1013tET
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 days
Max Age :  7.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  periventricular layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Periventricular Projection Neurons (PVPN)
Tertiary Cell Class :  Class 7, Pretectum-projecting, Thalamus-projecting, Retina-projecting
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2020-11-24
Date of Upload :  2024-04-30
Persistence Vector :  20170111_BGUG_HuC_ltRFP_d5_F1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Topography of a Visuomotor Transformation.

Measurements
Soma Surface :  1523.64 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  47
Number of Branches :  96
Overall Width :  39.24 μm
Overall Height :  147.5 μm
Overall Depth :  89.3 μm
Average Diameter :  4.47 μm
Total Length :  1176.67 μm
Total Surface :  17111.3 μm2
Total Volume :  20819.3 μm3
Max Euclidean Distance :  134.96 μm
Max Path Distance :  358.49 μm
Max Branch Order :  17
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  526
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  2.24
Average Bifurcation Angle Local :  88.78°
Average Bifurcation Angle Remote :  82.46°
Fractal Dimension :  1.05

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