8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_282885
Cell Name :  20161212_BGUG_HuC_ltRFP_d5_F1_N1
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-s1013tET
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 days
Max Age :  7.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  forebrain
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Periventricular Projection Neurons (PVPN)
Tertiary Cell Class :  Dorsal thalamus-projecting, Pretectum alar part-projecting, Class 1
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2020-11-24
Date of Upload :  2024-04-30
Persistence Vector :  20161212_BGUG_HuC_ltRFP_d5_F1_N1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Topography of a Visuomotor Transformation.

Measurements
Soma Surface :  1254.11 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  29
Number of Branches :  59
Overall Width :  38.02 μm
Overall Height :  151.01 μm
Overall Depth :  231.65 μm
Average Diameter :  4.79 μm
Total Length :  972.33 μm
Total Surface :  15216.8 μm2
Total Volume :  19830.8 μm3
Max Euclidean Distance :  201.01 μm
Max Path Distance :  461.16 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  454
Partition Asymmetry :  0.42
Average Rall's Ratio :  2.99
Average Bifurcation Angle Local :  82.01°
Average Bifurcation Angle Remote :  87.97°
Fractal Dimension :  1.07

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