8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_282598
Cell Name :  20160921_BGUG_HuC_ltRFP_d7_F3
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-s1013tET
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 days
Max Age :  7.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  torus semicircularis
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Periventricular Projection Neurons (PVPN)
Tertiary Cell Class :  Class 7, Dorsal thalamus-projecting, Pretectum-projecting
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2020-11-24
Date of Upload :  2024-04-30
Persistence Vector :  20160921_BGUG_HuC_ltRFP_d7_F3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Topography of a Visuomotor Transformation.

Measurements
Soma Surface :  1463.25 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  19
Number of Branches :  40
Overall Width :  37.72 μm
Overall Height :  31.49 μm
Overall Depth :  116.48 μm
Average Diameter :  5.08 μm
Total Length :  495.74 μm
Total Surface :  8185.1 μm2
Total Volume :  11462.8 μm3
Max Euclidean Distance :  89.21 μm
Max Path Distance :  155.81 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  210
Partition Asymmetry :  0.66
Average Rall's Ratio :  2.92
Average Bifurcation Angle Local :  85.5°
Average Bifurcation Angle Remote :  100.02°
Fractal Dimension :  1.03

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