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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_182357
Cell Name :  20160913-lif-Series044
Archive Name :  vonEngelhardt
Species Name :  mouse
Strain :  YAC128/BL6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.0 year
Max Age :  1.0 year
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  huntingtin gene (HTT) knock-in
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2022-04-05
Date of Upload :  2022-04-22
Persistence Vector :  20160913-lif-Series044.pvec
Note :  This mouse model codes for the entire human HTT on a yeast artificial chromosome (YAC) under control of the human promoter.

Reference Article
Related Article Reference :  C57BL/6 Background Attenuates mHTT Toxicity in the Striatum of YAC128 Mice.

Measurements
Soma Surface :  444.35 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  23
Number of Branches :  52
Overall Width :  133.26 μm
Overall Height :  194.05 μm
Overall Depth :  45.84 μm
Average Diameter :  1.79 μm
Total Length :  1956.75 μm
Total Surface :  11402 μm2
Total Volume :  5887.54 μm3
Max Euclidean Distance :  138.08 μm
Max Path Distance :  160.42 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  1243
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  1.08
Average Bifurcation Angle Local :  68.85°
Average Bifurcation Angle Remote :  73.71°
Fractal Dimension :  1.03

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