8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_132351
Cell Name :  20160908_1013_BGUG_HuC_ltRFP_d7_F5
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-s1013tET
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  right
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  periventricular
Tertiary Cell Class :  projection
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  20160908_1013_BGUG_HuC_ltRFP_d7_F5.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  1145.08 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  60
Number of Branches :  121
Overall Width :  44.97 μm
Overall Height :  84.99 μm
Overall Depth :  109.74 μm
Average Diameter :  4.14 μm
Total Length :  963.71 μm
Total Surface :  12909.4 μm2
Total Volume :  14332.7 μm3
Max Euclidean Distance :  143.3 μm
Max Path Distance :  242.94 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  601
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  1.98
Average Bifurcation Angle Local :  79.99°
Average Bifurcation Angle Remote :  74.5°
Fractal Dimension :  1.06

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