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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_182381
Cell Name :  20160810-lif-Series009
Archive Name :  vonEngelhardt
Species Name :  mouse
Strain :  YAC128/BL6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  huntingtin gene (HTT) knock-in
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2022-04-05
Date of Upload :  2022-04-22
Persistence Vector :  20160810-lif-Series009.pvec
Note :  This mouse model codes for the entire human HTT on a yeast artificial chromosome (YAC) under control of the human promoter.

Reference Article
Related Article Reference :  C57BL/6 Background Attenuates mHTT Toxicity in the Striatum of YAC128 Mice.

Measurements
Soma Surface :  74.1 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  34
Number of Branches :  73
Overall Width :  301.86 μm
Overall Height :  216.78 μm
Overall Depth :  23.13 μm
Average Diameter :  1.91 μm
Total Length :  2786.46 μm
Total Surface :  16740.9 μm2
Total Volume :  8612.73 μm3
Max Euclidean Distance :  210.19 μm
Max Path Distance :  261.79 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  1234
Partition Asymmetry :  0.43
Average Rall's Ratio :  4.06
Average Bifurcation Angle Local :  86.74°
Average Bifurcation Angle Remote :  79.61°
Fractal Dimension :  1.02

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