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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_182386
Cell Name :  20160810-lif-Series007
Archive Name :  vonEngelhardt
Species Name :  mouse
Strain :  YAC128/BL6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  huntingtin gene (HTT) knock-in
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2022-04-05
Date of Upload :  2022-04-22
Persistence Vector :  20160810-lif-Series007.pvec
Note :  This mouse model codes for the entire human HTT on a yeast artificial chromosome (YAC) under control of the human promoter.

Reference Article
Related Article Reference :  C57BL/6 Background Attenuates mHTT Toxicity in the Striatum of YAC128 Mice.

Measurements
Soma Surface :  175.45 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  41
Number of Branches :  88
Overall Width :  223.28 μm
Overall Height :  222.89 μm
Overall Depth :  34.72 μm
Average Diameter :  1.96 μm
Total Length :  2947 μm
Total Surface :  18590.1 μm2
Total Volume :  10139.9 μm3
Max Euclidean Distance :  161.07 μm
Max Path Distance :  233.1 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  1320
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  2.49
Average Bifurcation Angle Local :  75.69°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.23°
Fractal Dimension :  1.02

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