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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_182387
Cell Name :  20160627-lif-Series030
Archive Name :  vonEngelhardt
Species Name :  mouse
Strain :  YAC128/BL6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  huntingtin gene (HTT) knock-in
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2022-04-05
Date of Upload :  2022-04-22
Persistence Vector :  20160627-lif-Series030.pvec
Note :  This mouse model codes for the entire human HTT on a yeast artificial chromosome (YAC) under control of the human promoter.

Reference Article
Related Article Reference :  C57BL/6 Background Attenuates mHTT Toxicity in the Striatum of YAC128 Mice.

Measurements
Soma Surface :  980.73 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  35
Number of Branches :  75
Overall Width :  200.79 μm
Overall Height :  310.33 μm
Overall Depth :  38.38 μm
Average Diameter :  1.88 μm
Total Length :  3334.04 μm
Total Surface :  21103.2 μm2
Total Volume :  12430.5 μm3
Max Euclidean Distance :  200.57 μm
Max Path Distance :  217.81 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  2058
Partition Asymmetry :  0.38
Average Rall's Ratio :  1.41
Average Bifurcation Angle Local :  67.23°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.24°
Fractal Dimension :  1.02

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