8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_182388
Cell Name :  20160624-lif-Series020
Archive Name :  vonEngelhardt
Species Name :  mouse
Strain :  YAC128/BL6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  huntingtin gene (HTT) knock-in
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2022-04-05
Date of Upload :  2022-04-22
Persistence Vector :  20160624-lif-Series020.pvec
Note :  This mouse model codes for the entire human HTT on a yeast artificial chromosome (YAC) under control of the human promoter.

Reference Article
Related Article Reference :  C57BL/6 Background Attenuates mHTT Toxicity in the Striatum of YAC128 Mice.

Measurements
Soma Surface :  320.7 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  31
Number of Branches :  69
Overall Width :  208.56 μm
Overall Height :  224.32 μm
Overall Depth :  69.64 μm
Average Diameter :  1.76 μm
Total Length :  2866.22 μm
Total Surface :  16145.7 μm2
Total Volume :  7774.29 μm3
Max Euclidean Distance :  164.32 μm
Max Path Distance :  188.15 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  1939
Partition Asymmetry :  0.39
Average Rall's Ratio :  2.7
Average Bifurcation Angle Local :  69.2°
Average Bifurcation Angle Remote :  55.64°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website