8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_282799
Cell Name :  20160601_BGUG_HuC_ltRFP_d6_F1
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-s1013tET
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 days
Max Age :  7.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  stratum marginale
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Periventricular Projection Neurons (PVPN)
Tertiary Cell Class :  Dorsal thalamus-projecting, Class 4, Hypothalamus-projecting
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2020-11-24
Date of Upload :  2024-04-30
Persistence Vector :  20160601_BGUG_HuC_ltRFP_d6_F1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Topography of a Visuomotor Transformation.

Measurements
Soma Surface :  1098.38 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  51
Number of Branches :  104
Overall Width :  75.16 μm
Overall Height :  251.12 μm
Overall Depth :  153.19 μm
Average Diameter :  3.76 μm
Total Length :  1431.72 μm
Total Surface :  17644.9 μm2
Total Volume :  18299.3 μm3
Max Euclidean Distance :  269.11 μm
Max Path Distance :  569.31 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  756
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  1.99
Average Bifurcation Angle Local :  86.86°
Average Bifurcation Angle Remote :  90.99°
Fractal Dimension :  1.07

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