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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_97883
Cell Name :  20160126_6OHDA-8
Archive Name :  Bevan_Chu
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  32 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  subthalamic nucleus
Tertiary Brain Region :  lateral
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  glutamatergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  6-hydroxydopamine (6-OHDA)-lesion
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-08-21
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  20160126_6OHDA-8.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Loss of Hyperdirect Pathway Cortico-Subthalamic Inputs Following Degeneration of Midbrain Dopamine Neurons.

Measurements
Soma Surface :  984.54 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  2
Number of Branches :  7
Overall Width :  47.76 μm
Overall Height :  137.2 μm
Overall Depth :  18.57 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  281 μm
Total Surface :  868.77 μm2
Total Volume :  228.66 μm3
Max Euclidean Distance :  100.07 μm
Max Path Distance :  111.48 μm
Max Branch Order :  1
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  76
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  1.33
Average Bifurcation Angle Local :  69.76°
Average Bifurcation Angle Remote :  87.94°
Fractal Dimension :  1.01

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