8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_97846
Cell Name :  20160119_sham5
Archive Name :  Bevan_Chu
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  32 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  subthalamic nucleus
Tertiary Brain Region :  lateral
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  glutamatergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-08-21
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  20160119_sham5.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Loss of Hyperdirect Pathway Cortico-Subthalamic Inputs Following Degeneration of Midbrain Dopamine Neurons.

Measurements
Soma Surface :  867.74 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  3
Number of Branches :  11
Overall Width :  149.32 μm
Overall Height :  149.06 μm
Overall Depth :  12.88 μm
Average Diameter :  0.84 μm
Total Length :  636.97 μm
Total Surface :  1738.29 μm2
Total Volume :  419.56 μm3
Max Euclidean Distance :  146.26 μm
Max Path Distance :  153.21 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  229
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  1.59
Average Bifurcation Angle Local :  67.78°
Average Bifurcation Angle Remote :  45.65°
Fractal Dimension :  1.03

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