8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_97863
Cell Name :  20160111_cell5
Archive Name :  Bevan_Chu
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  32 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  subthalamic nucleus
Tertiary Brain Region :  lateral
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  glutamatergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  6-hydroxydopamine (6-OHDA)-lesion
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-08-21
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  20160111_cell5.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Loss of Hyperdirect Pathway Cortico-Subthalamic Inputs Following Degeneration of Midbrain Dopamine Neurons.

Measurements
Soma Surface :  948.2 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  3
Number of Branches :  11
Overall Width :  46.75 μm
Overall Height :  93.89 μm
Overall Depth :  15.9 μm
Average Diameter :  0.6 μm
Total Length :  356.6 μm
Total Surface :  706.75 μm2
Total Volume :  121.53 μm3
Max Euclidean Distance :  60.48 μm
Max Path Distance :  80.3 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  136
Partition Asymmetry :  0.33
Average Rall's Ratio :  1.24
Average Bifurcation Angle Local :  76.95°
Average Bifurcation Angle Remote :  71.44°
Fractal Dimension :  1.03

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