8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_283018
Cell Name :  20150402_BGUG_HuC_ltRFP_d5_F3
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-s1013tET
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 days
Max Age :  7.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  stratum album central (sac)
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Periventricular Projection Neurons (PVPN)
Tertiary Cell Class :  Medulla oblongata-projecting, Class 3
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2020-11-24
Date of Upload :  2024-04-30
Persistence Vector :  20150402_BGUG_HuC_ltRFP_d5_F3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Topography of a Visuomotor Transformation.

Measurements
Soma Surface :  393.83 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  44
Number of Branches :  89
Overall Width :  35.23 μm
Overall Height :  318.89 μm
Overall Depth :  96.9 μm
Average Diameter :  3.05 μm
Total Length :  1060.27 μm
Total Surface :  10539.5 μm2
Total Volume :  8779.06 μm3
Max Euclidean Distance :  312.22 μm
Max Path Distance :  445.57 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  358
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  2.53
Average Bifurcation Angle Local :  86.63°
Average Bifurcation Angle Remote :  78.46°
Fractal Dimension :  1.06

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