8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_77975
Cell Name :  2014-09-11-3of4-40x
Archive Name :  Martina
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  28.0 days
Max Age :  35.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2017-04-19
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  2014-09-11-3of4-40x.pvec
Note :  Received sham surgery on left paw

Reference Article
Related Article Reference :  Reduced Glutamatergic Currents and Dendritic Branching of Layer 5 Pyramidal Cells Contribute to Medial Prefrontal Cortex Deactivation in a Rat Model of NeuropathicPain.

Measurements
Soma Surface :  16750.3 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  40
Number of Branches :  85
Overall Width :  1109.8 μm
Overall Height :  3568.11 μm
Overall Depth :  1 μm
Average Diameter :  3.09 μm
Total Length :  23340.5 μm
Total Surface :  229605 μm2
Total Volume :  217991 μm3
Max Euclidean Distance :  3068.65 μm
Max Path Distance :  3418.62 μm
Max Branch Order :  17
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  2183
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2.14
Average Bifurcation Angle Local :  72.77°
Average Bifurcation Angle Remote :  67.76°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website