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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_77972
Cell Name :  2014-09-10-4of4-40x
Archive Name :  Martina
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  28.0 days
Max Age :  35.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2017-04-19
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  2014-09-10-4of4-40x.pvec
Note :  Received sham surgery on left paw

Reference Article
Related Article Reference :  Reduced Glutamatergic Currents and Dendritic Branching of Layer 5 Pyramidal Cells Contribute to Medial Prefrontal Cortex Deactivation in a Rat Model of NeuropathicPain.

Measurements
Soma Surface :  20472.8 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  62
Number of Branches :  132
Overall Width :  1350.5 μm
Overall Height :  3961.7 μm
Overall Depth :  1 μm
Average Diameter :  3.1 μm
Total Length :  34687.1 μm
Total Surface :  340815 μm2
Total Volume :  315177 μm3
Max Euclidean Distance :  3347.03 μm
Max Path Distance :  3769.21 μm
Max Branch Order :  20
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  3239
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  2.17
Average Bifurcation Angle Local :  67.14°
Average Bifurcation Angle Remote :  51.86°
Fractal Dimension :  1.01

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