8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_08227
Cell Name :  201311basal
Archive Name :  Smit-Rigter
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  60.0 days
Max Age :  60.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuron_Morpho.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neuron_Morpho
Date of Deposition :  2012-02-09
Date of Upload :  2013-01-15
Persistence Vector :  201311basal.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Prenatal fluoxetine exposure induces life-long serotonin 5-HT(3) receptor-dependent cortical abnormalities and anxiety-like behaviour.

Measurements
Soma Surface :  2178.3 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  25
Number of Branches :  56
Overall Width :  254.83 μm
Overall Height :  379.52 μm
Overall Depth :  47 μm
Average Diameter :  0.5 μm
Total Length :  2541.04 μm
Total Surface :  4160.42 μm2
Total Volume :  2304.67 μm3
Max Euclidean Distance :  228.99 μm
Max Path Distance :  249.08 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  319
Partition Asymmetry :  0.23
Average Rall's Ratio :  0.84
Average Bifurcation Angle Local :  72.71°
Average Bifurcation Angle Remote :  70.3°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website