8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_149542
Cell Name :  20120320sc4
Archive Name :  Topolnik
Species Name :  mouse
Strain :  Vip-eGFP
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  20.0 days
Max Age :  40.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  20 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  oriens/alveus border
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  GABAergic
Tertiary Cell Class :  Vasoactive Intestinal Peptide (VIP)-positive, subiculum-projecting
Original Format :  Neurolucida.nrx
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-07
Date of Upload :  2021-01-26
Persistence Vector :  20120320sc4.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Transcriptomic profile of the subiculum-projecting VIP GABAergic neurons in the mouse CA1 hippocampus.

Measurements
Soma Surface :  756.99 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  721
Number of Branches :  1445
Overall Width :  581.8 μm
Overall Height :  1313.92 μm
Overall Depth :  100.06 μm
Average Diameter :  1.17 μm
Total Length :  38417.9 μm
Total Surface :  135827 μm2
Total Volume :  44658.5 μm3
Max Euclidean Distance :  1111.52 μm
Max Path Distance :  3120.97 μm
Max Branch Order :  63
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  26081
Partition Asymmetry :  0.71
Average Rall's Ratio :  1.35
Average Bifurcation Angle Local :  96.1°
Average Bifurcation Angle Remote :  87.52°
Fractal Dimension :  1.06

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