8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_33283
Cell Name :  20120112-1-2
Archive Name :  Lien
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  16.0 days
Max Age :  25.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer, hilus
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  dendritic targeting
Tertiary Cell Class :  HIPP
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2014-02-24
Date of Upload :  2015-10-06
Persistence Vector :  20120112-1-2.pvec
Note :  Neuron is in Granule cell layer and Hilus border

Reference Article
Related Article Reference :  Rapid dynamic changes of dendritic inhibition in the dentate gyrus by presynaptic activity patterns.

Measurements
Soma Surface :  4260.14 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  160
Number of Branches :  320
Overall Width :  481.33 μm
Overall Height :  452.5 μm
Overall Depth :  142.1 μm
Average Diameter :  2.32 μm
Total Length :  33756.3 μm
Total Surface :  260510 μm2
Total Volume :  236013 μm3
Max Euclidean Distance :  401.42 μm
Max Path Distance :  1507.49 μm
Max Branch Order :  16
Average Contraction :  0.54
Total Fragmentation :  40056
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  2.46
Average Bifurcation Angle Local :  84.09°
Average Bifurcation Angle Remote :  75.52°
Fractal Dimension :  1.14

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website