8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_252334
Cell Name :  20110512JK-4
Archive Name :  Staiger
Species Name :  mouse
Strain :  Reeler (rlr)
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  20.0 days
Max Age :  32.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  barrel
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Thick-tufted, repetitive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Reelin-deficient
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  thalamocortical
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 0.15% in xy, 0.4% in z
Not corrected
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2023-01-04
Date of Upload :  2023-01-26
Persistence Vector :  20110512JK-4.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Repetitively burst-spiking neurons in reeler mice show conserved but also highly variable morphological features of layer Vb-fated "thick-tufted" pyramidal cells.

Measurements
Soma Surface :  957.06 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  83
Number of Branches :  175
Overall Width :  954.83 μm
Overall Height :  1025.55 μm
Overall Depth :  352.11 μm
Average Diameter :  0.55 μm
Total Length :  14328.5 μm
Total Surface :  24753.1 μm2
Total Volume :  5177.79 μm3
Max Euclidean Distance :  890.28 μm
Max Path Distance :  1741.74 μm
Max Branch Order :  15
Average Contraction :  0.83
Total Fragmentation :  9902
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  1.56
Average Bifurcation Angle Local :  79.67°
Average Bifurcation Angle Remote :  68.08°
Fractal Dimension :  1.06

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