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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36077
Cell Name :  2010-01-07-5
Archive Name :  McBain
Species Name :  mouse
Strain :  GAD65-GFP
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  17.0 days
Max Age :  17.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  stratum lacunosum-moleculare
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  GABAergic
Tertiary Cell Class :  Caudal Ganglionic Eminence (CGE)-derived, Somatostatin (SOM)-positive, Neuropeptide Y (NPY)-positive, Chicken ovalbumin upstream promoter transcription factor 2 (CoupTFII)-positive, Serotonin receptor type 3A (5-HT3)-positive, Enkephalin (Enk)-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2012-01-13
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  2010-01-07-5.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A blueprint for the spatiotemporal origins of mouse hippocampal interneuron diversity.

Measurements
Soma Surface :  19565.7 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  165
Number of Branches :  334
Overall Width :  817.29 μm
Overall Height :  1165.1 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.59 μm
Total Length :  13258.3 μm
Total Surface :  24574.8 μm2
Total Volume :  3624.79 μm3
Max Euclidean Distance :  940.84 μm
Max Path Distance :  1980.13 μm
Max Branch Order :  47
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  1249
Partition Asymmetry :  0.66
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  98.97°
Average Bifurcation Angle Remote :  94.69°
Fractal Dimension :  1.02

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