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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36074
Cell Name :  2009-12-30-5-6
Archive Name :  McBain
Species Name :  mouse
Strain :  GAD65-GFP
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  17.0 days
Max Age :  17.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  stratum lacunosum-moleculare
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  basket
Tertiary Cell Class :  GABAergic, Regular spiking, Cholecystokinin (CCK)-positive, Caudal Ganglionic Eminence (CGE)-derived, Chicken ovalbumin upstream promoter transcription factor 2 (CoupTFII)-positive, Serotonin receptor type 3A (5-HT3)-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2012-01-13
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  2009-12-30-5-6.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A blueprint for the spatiotemporal origins of mouse hippocampal interneuron diversity.

Measurements
Soma Surface :  23977.4 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  364
Number of Branches :  736
Overall Width :  1460.01 μm
Overall Height :  1192.9 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.59 μm
Total Length :  30114.9 μm
Total Surface :  55755.5 μm2
Total Volume :  8223.94 μm3
Max Euclidean Distance :  1072.56 μm
Max Path Distance :  3379.32 μm
Max Branch Order :  84
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  2818
Partition Asymmetry :  0.65
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  101.97°
Average Bifurcation Angle Remote :  93.93°
Fractal Dimension :  1.02

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