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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_49381
Cell Name :  2009-12-29-2-KE376
Archive Name :  McBain
Species Name :  mouse
Strain :  GAD65-GFP
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  16.0 days
Max Age :  16.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  stratum lucidum
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  GABAergic
Tertiary Cell Class :  mossy fiber associated, Regular spiking, Caudal Ganglionic Eminence (CGE)-derived, Parvalbumin (PV)-negative, Calretinin (CR)-negative, Somatostatin (SOM)-negative, Neuropeptide Y (NPY)-negative, Chicken ovalbumin upstream promoter transcription factor 2 (CoupTFII)-negative, Vasoactive Intestinal Peptide (VIP)-positive, Neuronal Nitric Oxide Synthase (nNOS)-negative, Cholecystokinin (CCK)-positive, Serotonin receptor type 3A (5-HT3)-positive, Enkephalin (Enk)-negative, Vesicular glutamate transporter type 3 (VGluT3)-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-11-19
Date of Upload :  2016-09-01
Persistence Vector :  2009-12-29-2-KE376.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A blueprint for the spatiotemporal origins of mouse hippocampal interneuron diversity.

Measurements
Soma Surface :  8274.22 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  200
Number of Branches :  405
Overall Width :  954.64 μm
Overall Height :  1732.96 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.59 μm
Total Length :  16183.5 μm
Total Surface :  29996.8 μm2
Total Volume :  4424.52 μm3
Max Euclidean Distance :  1425.25 μm
Max Path Distance :  1801.19 μm
Max Branch Order :  56
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  1818
Partition Asymmetry :  0.66
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  82.57°
Average Bifurcation Angle Remote :  75.45°
Fractal Dimension :  1.02

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