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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36070
Cell Name :  2009-12-28-4
Archive Name :  McBain
Species Name :  mouse
Strain :  Nkx2.1Cre-RCE
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  19.0 days
Max Age :  19.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  hilus
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  GABAergic
Tertiary Cell Class :  Medial Ganglionic Eminence (MGE)-derived, Calretinin (CR)-positive, Parvalbumin (PV)-positive, Somatostatin (SOM)-positive, Neuropeptide Y (NPY)-positive, Chicken ovalbumin upstream promoter transcription factor 2 (CoupTFII)-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2012-01-13
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  2009-12-28-4.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A blueprint for the spatiotemporal origins of mouse hippocampal interneuron diversity.

Measurements
Soma Surface :  33379.4 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  163
Number of Branches :  333
Overall Width :  1007.19 μm
Overall Height :  1321.07 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.59 μm
Total Length :  16362.4 μm
Total Surface :  30328.3 μm2
Total Volume :  4473.42 μm3
Max Euclidean Distance :  1065.88 μm
Max Path Distance :  1722.62 μm
Max Branch Order :  41
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  1768
Partition Asymmetry :  0.64
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  99.9°
Average Bifurcation Angle Remote :  91.44°
Fractal Dimension :  1.02

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