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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36068
Cell Name :  2009-12-28-14
Archive Name :  McBain
Species Name :  mouse
Strain :  Nkx2.1Cre-RCE
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  19.0 days
Max Age :  19.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  stratum oriens
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  GABAergic
Tertiary Cell Class :  Medial Ganglionic Eminence (MGE)-derived, Calretinin (CR)-positive, Parvalbumin (PV)-positive, Somatostatin (SOM)-positive, Neuropeptide Y (NPY)-positive, Cholecystokinin (CCK)-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2012-01-13
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  2009-12-28-14.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A blueprint for the spatiotemporal origins of mouse hippocampal interneuron diversity.

Measurements
Soma Surface :  34342.1 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  218
Number of Branches :  443
Overall Width :  1027.37 μm
Overall Height :  1311.11 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.59 μm
Total Length :  18150 μm
Total Surface :  33641.7 μm2
Total Volume :  4962.15 μm3
Max Euclidean Distance :  1070.56 μm
Max Path Distance :  2127.29 μm
Max Branch Order :  48
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  2067
Partition Asymmetry :  0.63
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  97.34°
Average Bifurcation Angle Remote :  93.52°
Fractal Dimension :  1.02

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