8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36067
Cell Name :  2009-12-28-13
Archive Name :  McBain
Species Name :  mouse
Strain :  Nkx2.1Cre-RCE
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  19.0 days
Max Age :  19.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  hilus
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  GABAergic
Tertiary Cell Class :  Medial Ganglionic Eminence (MGE)-derived, Calretinin (CR)-positive, Neuronal Nitric Oxide Synthase (nNOS)-positive, Chicken ovalbumin upstream promoter transcription factor 2 (CoupTFII)-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2012-01-13
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  2009-12-28-13.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A blueprint for the spatiotemporal origins of mouse hippocampal interneuron diversity.

Measurements
Soma Surface :  16791.3 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  158
Number of Branches :  322
Overall Width :  1104.05 μm
Overall Height :  943.31 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.59 μm
Total Length :  13144.2 μm
Total Surface :  24363.3 μm2
Total Volume :  3593.59 μm3
Max Euclidean Distance :  695.47 μm
Max Path Distance :  3103.17 μm
Max Branch Order :  53
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  1656
Partition Asymmetry :  0.69
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  98.63°
Average Bifurcation Angle Remote :  92.22°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website