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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36063
Cell Name :  2009-12-23-5
Archive Name :  McBain
Species Name :  mouse
Strain :  Nkx2.1Cre-RCE
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  13.0 days
Max Age :  13.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  stratum oriens
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  GABAergic
Tertiary Cell Class :  Ivy, Late spiking, Medial Ganglionic Eminence (MGE)-derived, Neuropeptide Y (NPY)-positive, Cholecystokinin (CCK)-positive, Neuronal Nitric Oxide Synthase (nNOS)-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2012-01-13
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  2009-12-23-5.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A blueprint for the spatiotemporal origins of mouse hippocampal interneuron diversity.

Measurements
Soma Surface :  14793.8 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  361
Number of Branches :  728
Overall Width :  992.84 μm
Overall Height :  665.14 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.59 μm
Total Length :  20338.5 μm
Total Surface :  37698.3 μm2
Total Volume :  5560.49 μm3
Max Euclidean Distance :  699.35 μm
Max Path Distance :  2463.7 μm
Max Branch Order :  94
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  2442
Partition Asymmetry :  0.7
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  102.7°
Average Bifurcation Angle Remote :  97.5°
Fractal Dimension :  1.03

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