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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36061
Cell Name :  2009-12-11-9
Archive Name :  McBain
Species Name :  mouse
Strain :  Nkx2.1Cre-RCE
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  18.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  stratum radiatum
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  GABAergic
Tertiary Cell Class :  Ivy, Late spiking, Medial Ganglionic Eminence (MGE)-derived, Neuropeptide Y (NPY)-positive, Cholecystokinin (CCK)-positive, Neuronal Nitric Oxide Synthase (nNOS)-positive, Enkephalin (Enk)-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2012-01-13
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  2009-12-11-9.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A blueprint for the spatiotemporal origins of mouse hippocampal interneuron diversity.

Measurements
Soma Surface :  10765.9 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  142
Number of Branches :  289
Overall Width :  1051.32 μm
Overall Height :  743.86 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.59 μm
Total Length :  17402 μm
Total Surface :  32255.2 μm2
Total Volume :  4757.65 μm3
Max Euclidean Distance :  772.3 μm
Max Path Distance :  1868.13 μm
Max Branch Order :  43
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  2227
Partition Asymmetry :  0.62
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  89.93°
Average Bifurcation Angle Remote :  80.94°
Fractal Dimension :  1.02

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