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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36060
Cell Name :  2009-12-11-6
Archive Name :  McBain
Species Name :  mouse
Strain :  Nkx2.1Cre-RCE
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  18.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  stratum oriens
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  GABAergic
Tertiary Cell Class :  Parvalbumin (PV)-positive, Medial Ganglionic Eminence (MGE)-derived, Somatostatin (SOM)-positive, Neuropeptide Y (NPY)-positive, Chicken ovalbumin upstream promoter transcription factor 2 (CoupTFII)-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2012-01-13
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  2009-12-11-6.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A blueprint for the spatiotemporal origins of mouse hippocampal interneuron diversity.

Measurements
Soma Surface :  32852.5 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  120
Number of Branches :  247
Overall Width :  1145.93 μm
Overall Height :  1346.89 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.59 μm
Total Length :  19007.6 μm
Total Surface :  35231.3 μm2
Total Volume :  5196.62 μm3
Max Euclidean Distance :  1311.71 μm
Max Path Distance :  3038.43 μm
Max Branch Order :  34
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  1967
Partition Asymmetry :  0.6
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  90.48°
Average Bifurcation Angle Remote :  90.01°
Fractal Dimension :  1.02

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