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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36048
Cell Name :  2009-12-08-3
Archive Name :  McBain
Species Name :  mouse
Strain :  Nkx2.1Cre-RCE
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  15.0 days
Max Age :  15.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  GABAergic
Tertiary Cell Class :  Medial Ganglionic Eminence (MGE)-derived, Calretinin (CR)-positive, Somatostatin (SOM)-positive, Neuropeptide Y (NPY)-positive, Cholecystokinin (CCK)-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2012-01-13
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  2009-12-08-3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A blueprint for the spatiotemporal origins of mouse hippocampal interneuron diversity.

Measurements
Soma Surface :  42607.9 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  287
Number of Branches :  579
Overall Width :  1013.45 μm
Overall Height :  1680.17 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.59 μm
Total Length :  29440.6 μm
Total Surface :  54569.3 μm2
Total Volume :  8048.97 μm3
Max Euclidean Distance :  1503.95 μm
Max Path Distance :  3081.9 μm
Max Branch Order :  59
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  3773
Partition Asymmetry :  0.62
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  97.07°
Average Bifurcation Angle Remote :  86.31°
Fractal Dimension :  1.02

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