8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_07820
Cell Name :  2007-10-07-D1
Archive Name :  Meyer
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  26.0 days
Max Age :  42.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  50 grams
Max Weight :  100 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  barrel, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Thick-tufted
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  thalamocortical
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2011-01-21
Date of Upload :  2012-05-17
Persistence Vector :  2007-10-07-D1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Cell type-specific thalamic innervation in a column of rat vibrissal cortex

Measurements
Soma Surface :  1048.68 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  54
Number of Branches :  114
Overall Width :  279.23 μm
Overall Height :  1383.67 μm
Overall Depth :  142.55 μm
Average Diameter :  1.09 μm
Total Length :  8403.79 μm
Total Surface :  29809.9 μm2
Total Volume :  12343.8 μm3
Max Euclidean Distance :  1303.18 μm
Max Path Distance :  1427.88 μm
Max Branch Order :  24
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  2214
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  1.36
Average Bifurcation Angle Local :  79.13°
Average Bifurcation Angle Remote :  71.31°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website