8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_98580
Cell Name :  2-19-2016-slice-2
Archive Name :  Danzer
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.2 months
Max Age :  8.2 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  PTEN Knockout
Staining Method :  Streptavidin-Alexa Fluor 488
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-07-25
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  2-19-2016-slice-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  PTEN deletion increases hippocampal granule cell excitability in male and female mice.

Measurements
Soma Surface :  580.54 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  25
Number of Branches :  56
Overall Width :  133.62 μm
Overall Height :  281.39 μm
Overall Depth :  64.5 μm
Average Diameter :  0.16 μm
Total Length :  3331.56 μm
Total Surface :  1656.02 μm2
Total Volume :  66.3 μm3
Max Euclidean Distance :  248.5 μm
Max Path Distance :  293.33 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  1020
Partition Asymmetry :  0.43
Average Rall's Ratio :  1.94
Average Bifurcation Angle Local :  53.79°
Average Bifurcation Angle Remote :  31.36°
Fractal Dimension :  1.03

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