8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_112679
Cell Name :  1a_5xFAD_DG_GC_7
Archive Name :  vonEngelhardt
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6N
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.0 year
Max Age :  1.0 year
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  old
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  5xFAD Alzheimer model (APP overexpression)
Staining Method :  Biocytin + Alexa 594
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2019-01-22
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  1a_5xFAD_DG_GC_7.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  NMDA receptors mediate synaptic depression, but not spine loss in the dentate gyrus of adult amyloid Beta (Abeta) overexpressing mice.

Measurements
Soma Surface :  160.8 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  17
Number of Branches :  36
Overall Width :  194.68 μm
Overall Height :  250.8 μm
Overall Depth :  25.04 μm
Average Diameter :  1.33 μm
Total Length :  2823.25 μm
Total Surface :  12047.3 μm2
Total Volume :  4579.39 μm3
Max Euclidean Distance :  285.7 μm
Max Path Distance :  302.59 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  854
Partition Asymmetry :  0.4
Average Rall's Ratio :  1.75
Average Bifurcation Angle Local :  47.47°
Average Bifurcation Angle Remote :  24.98°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website