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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_112680
Cell Name :  1a_5xFAD_DG_GC_6
Archive Name :  vonEngelhardt
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6N
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.0 year
Max Age :  1.0 year
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  old
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  5xFAD Alzheimer model (APP overexpression)
Staining Method :  Biocytin + Alexa 594
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2019-01-22
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  1a_5xFAD_DG_GC_6.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  NMDA receptors mediate synaptic depression, but not spine loss in the dentate gyrus of adult amyloid Beta (Abeta) overexpressing mice.

Measurements
Soma Surface :  304.96 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  16
Number of Branches :  35
Overall Width :  187.4 μm
Overall Height :  188.17 μm
Overall Depth :  39.71 μm
Average Diameter :  1.71 μm
Total Length :  2251.26 μm
Total Surface :  12773.6 μm2
Total Volume :  6319.91 μm3
Max Euclidean Distance :  260.45 μm
Max Path Distance :  269.96 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  1688
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  1.15
Average Bifurcation Angle Local :  54.55°
Average Bifurcation Angle Remote :  32.54°
Fractal Dimension :  1.01

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