8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_109378
Cell Name :  1_cell07_20xz-ims
Archive Name :  Huang_JY
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J + FVB
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, barrel, layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  stellate
Tertiary Cell Class :  Spiny
Original Format :  Imaris.hoc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  td Tomato fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2018-10-22
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  1_cell07_20xz-ims.pvec
Note :  Nex-Cre carrier with IUE overexpression

Reference Article
Related Article Reference :  mGluR5 Tunes NGF/TrkA Signaling to Orient Spiny Stellate Neuron Dendrites Toward Thalamocortical Axons During Whisker-Barrel Map Formation.

Measurements
Soma Surface :  15.11 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  6
Number of Branches :  17
Overall Width :  101.58 μm
Overall Height :  120.28 μm
Overall Depth :  18.16 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  649.48 μm
Total Surface :  510.1 μm2
Total Volume :  31.88 μm3
Max Euclidean Distance :  95.62 μm
Max Path Distance :  112.94 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  1165
Partition Asymmetry :  0.22
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  87.61°
Average Bifurcation Angle Remote :  73.42°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website