8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_117386
Cell Name :  1_56
Archive Name :  Banerjee
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  18.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Effective RNF2 RNAi
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not applicable
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2019-06-10
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  1_56.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Modulation of hippocampal synapse maturation by activity-regulated E3 ligase via non-canonical pathway.

Measurements
Soma Surface :  61.32 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  315
Number of Branches :  633
Overall Width :  60.8 μm
Overall Height :  107.32 μm
Overall Depth :  1.22 μm
Average Diameter :  0.24 μm
Total Length :  2121.72 μm
Total Surface :  2220.1 μm2
Total Volume :  384.29 μm3
Max Euclidean Distance :  114.35 μm
Max Path Distance :  190 μm
Max Branch Order :  90
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  9628
Partition Asymmetry :  0.66
Average Rall's Ratio :  2.64
Average Bifurcation Angle Local :  71.68°
Average Bifurcation Angle Remote :  54.5°
Fractal Dimension :  1.08

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website