8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_162257
Cell Name :  1947-C3-N1
Archive Name :  Koehl
Species Name :  mouse
Strain :  S6K1-/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 months
Max Age :  7.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  glutamatergic, newborn
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  protein S6 kinase 1 knock-out (S6K1 KO)
Staining Method :  green fluorescent protein, immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-09-02
Date of Upload :  2021-09-08
Persistence Vector :  1947-C3-N1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Inhibition of mTOR signaling by genetic removal of p70 S6 Kinase 1 leads to anxiety-like disorders

Measurements
Soma Surface :  452.54 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  2
Number of Branches :  5
Overall Width :  38.08 μm
Overall Height :  70.13 μm
Overall Depth :  14.71 μm
Average Diameter :  0.09 μm
Total Length :  186.62 μm
Total Surface :  52.77 μm2
Total Volume :  1.19 μm3
Max Euclidean Distance :  82.42 μm
Max Path Distance :  94.57 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  59
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  78.1°
Average Bifurcation Angle Remote :  24.22°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website