8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_275635
Cell Name :  1935_S3_L2_fitvolume-000
Archive Name :  Ciganok-Huckels_Jehasse_Kampa
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  64.0 days
Max Age :  64.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2023-08-29
Date of Upload :  2024-02-15
Persistence Vector :  1935_S3_L2_fitvolume-000.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Postnatal development of electrophysiological and morphological properties in layer 2/3 and layer 5 pyramidal neurons in the mouse primary visual cortex.

Measurements
Soma Surface :  1668.48 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  54
Number of Branches :  117
Overall Width :  239.22 μm
Overall Height :  336.09 μm
Overall Depth :  73.77 μm
Average Diameter :  3.84 μm
Total Length :  6476.99 μm
Total Surface :  87384.4 μm2
Total Volume :  221918 μm3
Max Euclidean Distance :  251.16 μm
Max Path Distance :  426.73 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.71
Total Fragmentation :  3092
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  5.32
Average Bifurcation Angle Local :  86.82°
Average Bifurcation Angle Remote :  83.51°
Fractal Dimension :  1.1

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