8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_253004
Cell Name :  19-34-4_63x_DS1_01
Archive Name :  Hayes
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  70.0 days
Max Age :  80.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  20 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  dorsal nucleus, Putamen
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Maternal immune activation
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2022-09-29
Date of Upload :  2023-02-06
Persistence Vector :  19-34-4_63x_DS1_01.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Prenatal immune stress blunts microglia reactivity, impairing neurocircuitry.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  26
Number of Branches :  54
Overall Width :  16 μm
Overall Height :  45.7 μm
Overall Depth :  26.99 μm
Average Diameter :  0.6 μm
Total Length :  369.11 μm
Total Surface :  700.71 μm2
Total Volume :  113.8 μm3
Max Euclidean Distance :  32.79 μm
Max Path Distance :  44.08 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  2492
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2.03
Average Bifurcation Angle Local :  65.76°
Average Bifurcation Angle Remote :  87.71°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website