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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_135210
Cell Name :  188-1_2-1_traced-tif
Archive Name :  Gradinaru
Species Name :  mouse
Strain :  129T2/SvEmsJ::C57Bl/6NTac Nf1+/-
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  midbrain tegmentum
Tertiary Brain Region :  Ventral Tegmental Area
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  dopaminergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Th-VAST (Tyrosine hydroxylase Vector-Assisted Spectral Tracing)
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  10x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-05-04
Date of Upload :  2020-07-21
Persistence Vector :  188-1_2-1_traced-tif.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Optical dopamine monitoring with dLight1 reveals mesolimbic phenotypes in a mouse model of neurofibromatosis type 1.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  7
Number of Branches :  16
Overall Width :  163.77 μm
Overall Height :  543.06 μm
Overall Depth :  33.55 μm
Average Diameter :  1.23 μm
Total Length :  1666.8 μm
Total Surface :  6594.69 μm2
Total Volume :  2983.71 μm3
Max Euclidean Distance :  351.5 μm
Max Path Distance :  418.9 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  481
Partition Asymmetry :  0.69
Average Rall's Ratio :  1.35
Average Bifurcation Angle Local :  100.77°
Average Bifurcation Angle Remote :  85.48°
Fractal Dimension :  1.03

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