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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_135225
Cell Name :  187-1_c_traced-tif
Archive Name :  Gradinaru
Species Name :  mouse
Strain :  129T2/SvEmsJ::C57Bl/6NTac Nf1+/+
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  midbrain tegmentum
Tertiary Brain Region :  Ventral Tegmental Area
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  dopaminergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Neurofibromatosis type 1
Staining Method :  Th-VAST (Tyrosine hydroxylase Vector-Assisted Spectral Tracing)
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  10x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-05-04
Date of Upload :  2020-07-21
Persistence Vector :  187-1_c_traced-tif.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Optical dopamine monitoring with dLight1 reveals mesolimbic phenotypes in a mouse model of neurofibromatosis type 1.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  3
Number of Branches :  8
Overall Width :  54.6 μm
Overall Height :  333.2 μm
Overall Depth :  37.05 μm
Average Diameter :  1.25 μm
Total Length :  559.94 μm
Total Surface :  2405.61 μm2
Total Volume :  1297.51 μm3
Max Euclidean Distance :  228.81 μm
Max Path Distance :  323.65 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  163
Partition Asymmetry :  0.25
Average Rall's Ratio :  1.56
Average Bifurcation Angle Local :  109.1°
Average Bifurcation Angle Remote :  113.27°
Fractal Dimension :  1.06

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