8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_135220
Cell Name :  185-1-2-e_traced-tif
Archive Name :  Gradinaru
Species Name :  mouse
Strain :  129T2/SvEmsJ::C57Bl/6NTac Nf1+/-
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  midbrain tegmentum
Tertiary Brain Region :  Ventral Tegmental Area
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  dopaminergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Th-VAST (Tyrosine hydroxylase Vector-Assisted Spectral Tracing)
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  10x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-05-04
Date of Upload :  2020-07-21
Persistence Vector :  185-1-2-e_traced-tif.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Optical dopamine monitoring with dLight1 reveals mesolimbic phenotypes in a mouse model of neurofibromatosis type 1.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  6
Number of Branches :  14
Overall Width :  177.63 μm
Overall Height :  243.39 μm
Overall Depth :  52.33 μm
Average Diameter :  1.2 μm
Total Length :  1015.69 μm
Total Surface :  3911.08 μm2
Total Volume :  1484.66 μm3
Max Euclidean Distance :  204.63 μm
Max Path Distance :  283.31 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  324
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  1.34
Average Bifurcation Angle Local :  98.78°
Average Bifurcation Angle Remote :  90.12°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website