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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_89409
Cell Name :  180c1n3-2
Archive Name :  Denizet
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6JRj
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.5 months
Max Age :  2.5 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  main olfactory bulb
Secondary Brain Region :  stratum granulosum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  adult-born
Original Format :  Imaris.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  lipopolysaccharide injection
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  60  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2018-03-22
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  180c1n3-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Sensory deprivation increases phagocytosis of adult-born neurons by activated microglia in the olfactory bulb.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  3
Number of Branches :  7
Overall Width :  72.41 μm
Overall Height :  306.53 μm
Overall Depth :  13.22 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  550.02 μm
Total Surface :  1727.95 μm2
Total Volume :  431.99 μm3
Max Euclidean Distance :  320.24 μm
Max Path Distance :  335.91 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  1527
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  54.31°
Average Bifurcation Angle Remote :  38.64°
Fractal Dimension :  1.01

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