8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_156667
Cell Name :  17_L1_C15_N2
Archive Name :  Castanho_Oliveira
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6 Pld1-/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Phospholipase D1 (PLD1) Knockout
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water or oil
Magnification :  600x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-08-14
Date of Upload :  2021-06-10
Persistence Vector :  17_L1_C15_N2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Phospholipase D1 Ablation Disrupts Mouse Longitudinal Hippocampal Axis Organization and Functioning.

Measurements
Soma Surface :  1015.72 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  32
Number of Branches :  67
Overall Width :  127.76 μm
Overall Height :  279.39 μm
Overall Depth :  91 μm
Average Diameter :  0.07 μm
Total Length :  2762.54 μm
Total Surface :  607.51 μm2
Total Volume :  10.63 μm3
Max Euclidean Distance :  248.41 μm
Max Path Distance :  329.42 μm
Max Branch Order :  14
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  507
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  76.51°
Average Bifurcation Angle Remote :  72.62°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website