8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_109138
Cell Name :  17637_4
Archive Name :  Ruiyu
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6N
Structural Domains :  No Dendrites, No Soma, Axon
Physical Integrity :  Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  anterior cingulate
Tertiary Brain Region :  ventral
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  projection
Tertiary Cell Class :  corticostriatal
Original Format :  Amira.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  1  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Amira
Date of Deposition :  2019-01-24
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  17637_4.pvec
Note :  Projection specific AAV-retro-Cre sparse labeling

Reference Article
Related Article Reference :  Cell-type-specific and projection-specific brain-wide reconstruction of single neurons.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  504
Number of Branches :  1010
Overall Width :  3884.97 μm
Overall Height :  5402.8 μm
Overall Depth :  2292.08 μm
Average Diameter :  0.51 μm
Total Length :  123829 μm
Total Surface :  197789 μm2
Total Volume :  67173.9 μm3
Max Euclidean Distance :  6289.55 μm
Max Path Distance :  15949.8 μm
Max Branch Order :  42
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  17683
Partition Asymmetry :  0.61
Average Rall's Ratio :  4.69
Average Bifurcation Angle Local :  78.85°
Average Bifurcation Angle Remote :  73.48°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website