8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_133972
Cell Name :  170303_6_1
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-elavl3
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  brainstem
Secondary Brain Region :  epithalamus
Tertiary Brain Region :  Lateral habenula, left
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  170303_6_1.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  2260.54 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  15
Number of Branches :  31
Overall Width :  19.14 μm
Overall Height :  352.64 μm
Overall Depth :  106.35 μm
Average Diameter :  3.48 μm
Total Length :  782.33 μm
Total Surface :  8888.83 μm2
Total Volume :  9436.18 μm3
Max Euclidean Distance :  364.54 μm
Max Path Distance :  546.07 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  384
Partition Asymmetry :  0.68
Average Rall's Ratio :  2.32
Average Bifurcation Angle Local :  78.78°
Average Bifurcation Angle Remote :  87.23°
Fractal Dimension :  1.05

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