8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_132447
Cell Name :  170221_9_1
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-vGut2a
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  brainstem
Secondary Brain Region :  epithalamus
Tertiary Brain Region :  Lateral habenula, right
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  170221_9_1.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  1806.99 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  11
Number of Branches :  23
Overall Width :  46.33 μm
Overall Height :  443.33 μm
Overall Depth :  90.44 μm
Average Diameter :  3.56 μm
Total Length :  766.51 μm
Total Surface :  8681.54 μm2
Total Volume :  8151.57 μm3
Max Euclidean Distance :  459.21 μm
Max Path Distance :  625.42 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  371
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  2.61
Average Bifurcation Angle Local :  73.05°
Average Bifurcation Angle Remote :  52.33°
Fractal Dimension :  1.05

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