8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_132314
Cell Name :  170221_17_1
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-vGut2a
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  left
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  170221_17_1.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  2389.99 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  48
Number of Branches :  98
Overall Width :  82.12 μm
Overall Height :  387.98 μm
Overall Depth :  138.3 μm
Average Diameter :  3.87 μm
Total Length :  1652.65 μm
Total Surface :  20886 μm2
Total Volume :  23969.2 μm3
Max Euclidean Distance :  376.42 μm
Max Path Distance :  584.9 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  722
Partition Asymmetry :  0.62
Average Rall's Ratio :  2.75
Average Bifurcation Angle Local :  90.82°
Average Bifurcation Angle Remote :  89.21°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website